الحديث عن الأئمة كتاريخ هو حديث شيق، وهناك منهجان متبعان في كتابة هذا التاريخ. الأول دراسة هذا التاريخ عقائدياً، أو محاولة المطابقة بين مفرداته من جهة وبين إمضاء مرسوم سلفاً، فهناك صورة عقيدية إرشادية قبلية تؤثر وتفسر وتعلل. الثاني دراسة هذا التاريخ زمنياً بأسلوب يعتمد على الملاحظة الوثائقية للحوادث والمجريات المكوّنة لهذا التاريخ، ونظمها في نسق منهجي دقيق.
والمؤلف في كتابه هذا "الإمامة والتاريخ، اختار المنهج الزمني التاريخي الوثائقي في دراسة حياة ثلاثة من الأئمة، الذين صنعوا التاريخ على ضوء حركة الزمن. والأئمة الثلاثة الذين هم موضع هذا البحث التاريخي هم: الجواد والهادي والعسكر عليهم السلام. وقد تمّ ترتيب البحث ضمن ثلاثة أبواب. الباب الأول الإمام الجواد ورؤية تاريخية تحليلية، النص على إمامته، إمامته الموضوعية، الأصحاب والآل، ما وراء الظاهرة، نظام الوكالة الآفاق والدلالات. الباب الثاني: الإمام الهادي حياته وسيرته، الشيعة في عصر الإمام، النشاط السياسي للإمام الهادي، أصحابه وتلاميذه، الشخصية والدور، جهاده العلمي. الباب الثالث: الإمام العسكري ملامح من سيرته، أداة الكيان وتدبير شؤونه، آليات وأهداف، دراسة في بعض التوقيعات.